Учебные программы, по которым работает лицей, реализуются в соответствии с утвержденным учебным планом. Все программы можно разделить на группы:

1. Организация учебно-воспитательного процесса в 1-4-х классах заложена в Основной образовательной программе начального общего образования (далее – ООП НОО), в 5-9-х классах - в Основной образовательной программе основного общего образования (далее – ООП ООО), в 10-11 классах в Основной образовательной программе среднего общего образования (далее – ООП СОО), которые определяют содержание и организацию образовательного процесса на ступени начального общего образования и основного общего образования, среднего общего образования. Они направлены на формирование общей культуры, духовно-нравственного, социального, личностного и интеллектуального развития обучающихся в соответствии с требованиями федерального государственного образовательного стандарта начального общего образования и основного общего образования, среднего общего образования (далее - ФГОС) с учетом образовательных потребностей и запросов участников образовательного процесса. Данные программы представляют собой целостный документ, который регламентирует деятельность МАОУ «Лицей №3» ГО г. Стерлитамак РБ.